Der Duft von Agarholz entsteht durch eine komplexe Mischung aus Sesquiterpenen und Chromon-Derivaten, die im Harz infizierter Aquilaria-Bäume gebildet werden. Diese Moleküle besitzen mehrere Ringstrukturen und sauerstoffhaltige funktionelle Gruppen, die zum tiefen, holzigen und rauchigen Aroma beitragen. Ihre molekulare Komplexität verleiht Agarholz seinen reichen Charakter und ein langanhaltendes Duftprofil.